Chapitre I : Principales bactéries pathogènes pour l’homme.

 

 Classification des principales bactéries d’intérêt médical

       Les bactéries peuvent être classées et donc identifiées en fonction de plusieurs paramètres.

• Morphologie microscopique : coque, bacille, isolés, groupés en deux, en chainette, en amas … (Fig. 1).
• Morphologie macroscopique : taille – forme – couleur des colonies sur culture.
• Résultat de la coloration de gram : Gram positif – Gram négatif.
• Température de croissance.
• Besoins respiratoires : aérobie – anaérobie strict – aéro-anaérobie facultatif - micro aérophile.
• Mobilité.
• Présence de spores.
• Besoins nutritionnels : nécessité de substances particulières.

 

Figure 1 : Morphologie microscopique des bactéries (Prescott et al., 2003).

 

 

Tableau 2: Classification des bactéries (Prescott et al., 2003).

 

Coques à Gram Positif
Morphologie		Genre		Espèces
En amas		Staphylococcus		Staphylocccus aureus, Staphylocoque à coagulase négative
En chainette		Streptococcus		Streptocoque bêta hémolytique : Groupe A pyogenes, Groupe B agalactiae, Autres groupes : C, G, F …. Streptocoques alpha hemolytiques : mutans, oralis, sanguis, salivarius, complexe milleri (anginosus, constellatis, intermidius)
En diplocoque		Streptococcus		pneumoniae
En courtes chainette		Enterococcus		faecalis faecium
Coques à Gram Négatif
Morphologie			Genre	Espèces
En diplocoque			Neisseria	meningitidis gonorrheae
Bacille à Gram Négatif
Morphologie	Famille			Genre et Espèces
Bacille à Coloration bipolaire	Enterobactériaceae			Escherichia coli (colibacille) Klebsiella Citrobacter Enterobacter Proteus Serratia Providencia Morganella Salmonela (typhimurium) Shigella (sonnei) Yersinia (enterolitica)

 

 

Cocco bacilles		Brucella melitensis Haemophilus ( influenzae) Moraxella (catarralis) Pasteurella multocida Bordetella pertussis Legionella pneumoniae Kingella
Bacilles aérobies stricts	Pseudomonaceae	Pseudomonas aeruginosa ( bacille pyocyanique) Autres (Burkholderia – Stenotrophomonas ..) Acinetobacter baumannii
Vibrions	Vibrionaceae	Vibrio cholerae Autres Vibrions Campylobacter Helicobacter

 

Bacille à Gram Positif
Morphologie	Genre	Espèces
Petits	Listéria	monocytogenes
	Erysipelothryx	rhusiopathiae : bacille du rouget du porc
	Corynebacterium	diphteriae : bacille de LoefflerAutres : coryneformes
Grands	Bacillus	Anthracis : bacille du charbon Autres
	Nocardia

 

Mycoplasmes
Morphologie	Genre	Espèces
Sans paroi	Mycoplasme	pneumonie hominis Autres
	Ureaplasma	urealyticum

 

 

Mycobactéries
Morphologie		Genre	Espèces
Bacilles alcoolo-acido résistants		Mycobacterium	Tuberculosis : bacille de Koch (BK), bovis «atypiques» BCG Leprae : bacille de Hansen
Bactéries Anaérobies strictes
Morphologie	Genre			Espèces
Coques à Gram positif	Peptostreptococcus
Coques à Gram négatif	Veillonella
Bacilles à Gram positif	Clostridium Actinomyces Peptococcus Propionibacterim			tetani , perfringens , botulinum , difficile   acnes
Bacilles à Gram négatif	Bacteroïdes Prevotella Fusobacterium Porphyromonas Eubacterium

 

• Rappels sur la structure bactérienne

La structure de la paroi bactérienne dépend l’appartenance des bactéries au groupe des bactéries à Gram positif ou à Gram négatif. Les deux groupes possèdent en commun un constituant essentiel, spécifique au monde bactérien, le peptidoglycane. Ce constituant confère à la bactérie sa forme et sa rigidité qui lui permet de résister à la pression osmotique intra- cytoplasmique (Fig. 2).

 

 

 

Figure 2 : Structure de la paroi bactérienne des bactéries Gram positif et Gram négatif.

 

 

– Bactéries à Gram positif (BGP) : le peptidoglycane est la partie la plus externe de la bactérie. Il est plus épais que chez les bactéries à Gram négatif et entoure la membrane cytoplasmique de la bactérie.

– Bactéries à Gram négatif (BGN) : la paroi bactérienne contient un élément supplémentaire, la membrane externe, laquelle entoure le peptidoglycane qui est plus fin que chez les bactéries à Gram positif. La membrane externe est un élément très important dans la physiologie des BGN constituant une structure de résistance aux facteurs de défense de l’hôte. Son feuillet interne est essentiellement phospholipidique et son feuillet externe est majoritairement formé de lipopolysaccharides (ou endotoxines) et sont responsables du choc endotoxinique des infections à Gram négatif. L’espace situé entre les deux membranes est appelé l’espace péri plasmique, il contient donc le peptidoglycane mais aussi de nombreuses enzymes parmi lesquelles les bêta-lactamases.

Les protéines liant les pénicillines (PLP) : sont des protéines ancrés dans la membrane cytoplasmique et émergent dans l’espace péri-plasmique, elles sont toutes porteuses d’activités enzymatiques notamment la synthèse du peptidoglycane.

 

 Les principales bactéries pathogènes pour l’homme

 

Cocci à Gram positif

 

Les Staphylocoques

 

 Les Staphylocoques sont des cocci à Gram positif très résistants dans le milieu extérieur. Le genre Staphylococcus comporte deux espèces :

• Staphylococcus aureus (le staphylocoque à coagulase positive) qui possède un potentiel de pathogénicité important, impliqué dans les infections communautaires et nosocomiales.
• Staphylocoques à coagulase négative : pathogènes opportunistes impliqués dans les infections nosocomiales.

 

Historique

Les Staphylocoques sont observés par Pasteur en 1879 dans un pus de furoncle. Ils doivent leur nom à OGSTON (1881) qui les a mis en évidence dans des abcès aigus et chroniques.

 

Habitat

L’homme est le principal réservoir, qu’il soit malade ou porteur sain hébergeant des staphylocoques au niveau des fosses nasales, de l’intestin, de la peau ou de ses annexes glandulaires (aisselle, périnée). Les staphylocoques contaminent également les surfaces, l’air et l’eau. La transmission est avant tout interhumaine directe et manuportée.

 

Caractères bactériologiques

Ce sont des cocci à Gram positif, regroupés en amas (grappe de raisin), en tétrade ou en diplocoques (Fig. 3). Sont immobiles, dépourvus de spores, présentent une capsule polysaccharidique.

 

 

 

Figure 3: Les staphylocoques.

 

Les staphylocoques sont des germes peu exigeants et peuvent être isolés en bouillon ou sur des milieux solides simples tels que géloses ordinaires ou gélose au sang ou géloses sélectives (chapman). Ils sont aéro-anaérobie facultatifs, fermentent le glucose et le glycérol et possédant la catalase.

 

Pouvoir pathogène

Ce sont des Germes pyogènes par excellence, S.aureus est le microbe de la suppuration. Certaines souches agissent aussi par libération d'une ou de plusieurs toxines (intoxication alimentaire, syndrome de choc toxique, impetigo).

La fréquence et la gravité des infections à staphylocoques sont liées à trois principaux facteurs:

• le caractère ubiquitaire du germe,
• l'abaissement des défenses locales et générales des malades soumis à des soins intensifs, des interventions chirurgicales graves, etc.,
• et la fréquente résistance aux antibiotiques du staphylocoque, notamment du staphylocoque hospitalier.

Les différentes formes des infections staphylococciques sont :

• Formes cutanées : atteinte plus ou moins sévère des follicules pilo-sébacés (folliculite, furoncle, anthrax), atteinte péri-onguéale (onyxis, perionyxis, atteinte du tissu sous-cutané (panaris, phlegmons). Certaines formes superficielles (impetigo) peuvent se compliquer de lésions bulleuses graves lorsque la souche de staphylocoque est productrice d'exfoliatine.
• Formes muqueuses : otites, sinusites, mastoïdites, conjonctivites. 

Formes généralisées :

 Septicémie succédant à un foyer initial cutanéo-muqueux : diffusion par atteinte des veines (séquence : phlébite, caillot, embol septique en rapport respectivement avec action de la coagulase, de la fibrinolysine et de l'hyaluronidase). On l'observe principalement chez les sujets ayant des défenses immunitaires affaiblies, traumatisés, sujets soumis à une intervention chirurgicale grave, sujets en unité de soins intensifs, diabétiques, etc..., sujets âgés, nourrissons. Les septicémies à staphylocoques, qui sont de pronostic redoutable (20 à 30% de mortalité), se compliquent souvent de localisations viscérales, même lorsqu'elles sont peu symptomatiques : pleuro- pulmonaires (abcès bulleux), ostéo-articulaires (ostéomyélites), uro-génitales (phlegmon périnéphrétique), cérébrales (abcès du cerveau), cardiaques (endocardite aiguë).

• Formes intestinales : soit intoxication alimentaire par absorption de toxine préformée dans des aliments contaminés par un staphylocoque producteur d'entérotoxines, soit entérocolite aiguë pseudo-membraneuse à staphylocoque, consécutive à une antibiothérapie polyvalente massive et prolongée ayant sélectionné une souche entérotoxique.
• Syndrome de choc toxique décrit pour la première fois en 1978 (TODD). Il associe une hypotension artérielle importante avec état de choc, de la fièvre (> 39 °C), une érythrodermie diffuse, une desquamation des paumes et des plantes une à deux semaines après le début de la maladie et une atteinte pluriviscérale (digestive, musculaire, muqueuse, rénale, hépatique, neurologique, hématologique). Fait important, les hémocultures sont négatives tandis que les prélèvements locaux permettent de cultiver S.aureus. La majorité des cas publiés sont associés à l'usage de tampons vaginaux périodiques particuliers, retirés mamintenant du marché. Les signes cliniques sont liés à la production d'une exotoxine protéique (Toxic Shock Syndrome Toxin 1 ou TSST-1). D'autres toxines (entérotoxine B ou C) seraient impliquées dans le syndrome de choc toxique. Des syndromes similaires peuvent s'observer au cours d'infections par d'autres bactéries (exemple : Streptococcus A).